宇宙世紀0079、地球連邦とジオン公国が戦った一年戦争の末期、サイド4のスペースコロニー群、()ムーアはジオン軍の攻()撃によ()り破壊され()、多くの住人が命()を落とした。破壊されたコロニーや、撃沈された戦艦の残()骸が無()数に漂う暗礁()宙域では、ぶつかり合い帯電し()たデブリによって絶えず稲妻が閃()くようになり、いつしかそこは、『サンダーボルト宙域』と呼ばれるようになった。ムーア市民の生き残り()で構成された地球連邦軍所属部隊、ムーア同胞団は、故郷であったサンダーボルト宙域の奪還を悲願とし、()宙域のジオン軍を殲滅せんとしていた。連邦の進()軍を足止めせんとするジ()オン軍も、義肢兵の戦闘データ採取を目的に設立されたリビング()・デッド師団を展開。ムーア同胞団に所属しな()がら、故郷や自身の()出自に束縛される事を疎ましく思うイオ・フレミングと、過去の戦闘により両足を失い、今は()リ()ビング・デッド師団でエーススナイパ()ーとして活躍するダリ()ル・ローレンツは、戦場で対峙した時、互いに悟るのだった。ふたりは、殺し合()う宿命なのだと……。