宇宙世紀0079、地球連邦とジオン公国が戦った一年戦争の末期、サイド4のスペースコロニー群、ムーアはジオン軍の攻撃により破壊()され、()多くの住人が命を落とした。破壊されたコロニーや()、撃沈され()た戦艦の残骸が無数に漂う暗礁宙()域では、ぶつかり合い帯電したデブ()リによって絶えず稲妻が閃く()ようになり、いつしかそこは、『サンダーボルト宙域()』と呼ばれるようになった。ムーア市民の生き残りで構成された地球連邦軍所属部隊、ムーア同()胞団は、故郷であ()った()サンダーボルト宙()域の奪還を悲願とし、宙域のジオン軍を殲滅せ()んとしていた。連邦の進軍を足止めせんとするジオ()ン軍も、義肢兵の戦闘データ()採取を目的に設立されたリビング・デッド師団を展開()。ムーア()同胞団に所属しながら、故郷や自身の出自()に束縛される事を疎ましく思うイオ・フレミングと、過去の戦()闘により両足を失い、今はリビング・デッド師団でエー()ススナイパーとして活()躍するダリル・ローレンツは、戦場で対峙した時、互いに悟るのだ()った。ふたりは、殺し合う宿命なのだと……。