自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女,这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个()城()市——最()先进科学引导的学()院都()市中,超能力已经可以通过科学技术创造出来,但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的()少女还()是把上条当麻吓了一条。茵蒂克丝自称因()拥有十万三千本()魔导书而被魔法师追杀,而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家,上条如往日一般去学校学()习,但放学回家,却发现茵()蒂克丝倒在血泊之中。在科学与()魔术交叉的世界中,上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。